Петр Иванович Кротов родился в 1852 году в Глазовском уезде Вятской губернии. Первоначальное образование он получил в Вятской духовной семинарии, по окончании которой в 1874 году был зачислен в число студентов физико-математического факультета отделения естественных наук.